Nie darzymy ich sympatią bo kojarzą nam się z chorobami. Oprócz tych ,,groźnych’’, które szkodzą człowiekowi istnieją i takie, które są jego sprzymierzeńcem. Jedną z najważniejszych funkcji bakterii jest rozkład materii organicznej. Zdolność ta wykorzystywana jest w oczyszczalni ścieków, gdzie licznie występujące bakterie rozkładają  substancje organiczne zawarte w ściekach. Podczas biologicznego oczyszczania ścieków w procesach nitryfikacji, denitryfikacji i defosfatacji bakterie usuwają związki biogenne: azot i fosfor a tym samym przyczyniają się do zmniejszenia eutrofizacji wód powierzchniowych. Niewielka ilość bakterii nitkowatych w osadzie czynnym odgrywają również pozytywna rolę. Biorą one udział w wielu procesach biochemicznych tj. utlenianiu związków węgla, siarki
i żelaza. Bakterie hydrolityczne, kwasowe i metanowe decydują o prawidłowym procesie fermentacji metanowej.
W tym biologicznym procesie stabilizacji osadu wydziela się gaz -  metan, który wykorzystujemy do produkcji energii.
Bakterie choć są najmniejszymi istotami żywymi w oczyszczalni zarazem są głównymi i najważniejszymi bohaterami biologicznego oczyszczania ścieków.

   Ryc.1. Monokolonia bakterii w osadzie czynnym;

Ryc.2. Bakterie kumulujące polifosforany

Źródło rycin: E. Fiałkowska, J. Fyda, A.Pajdak-Stós, K. Wiąckowski; Osad czynny-biologia i analiza mikroskopowa. Oficyna Wydawnicza Impuls, Kraków 2005.